{"id":47095,"date":"2025-06-26T10:11:14","date_gmt":"2025-06-26T14:11:14","guid":{"rendered":"https:\/\/smartcherry.cl\/?p=47095"},"modified":"2025-06-27T11:26:13","modified_gmt":"2025-06-27T15:26:13","slug":"deteccion-temprana-de-virus-en-cerezos-y-otros-carozos-uno-de-los-pilares-para-una-produccion-sostenible","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/smartcherry.cl\/en\/manejos-agronomicos\/articulo-tecnico\/deteccion-temprana-de-virus-en-cerezos-y-otros-carozos-uno-de-los-pilares-para-una-produccion-sostenible\/","title":{"rendered":"Detecci\u00f3n temprana de virus en cerezos y otros carozos: Uno de los pilares para una producci\u00f3n sostenible"},"content":{"rendered":"

Hace unos a\u00f1os, China, el principal comprador de cerezas chilenas, comenz\u00f3 un protocolo de vigilancia sobre uno de los fitovirus m\u00e1s comunes de Prunus en el mundo, el denominado Prunus Necrotic Ring Spot Virus, m\u00e1s conocido por su sigla PNRSV.<\/em><\/strong><\/p>\n\n\n\n

En dicho momento, se aumentaron considerablemente las medidas de detecci\u00f3n para este virus, lo que refresc\u00f3 el conocimiento sobre estos pat\u00f3genos poco conocidos, muchas veces subestimados y que pueden afectar la productividad de forma directa, afectando la calidad de la fruta, o indirecta, afectando la sanidad total del \u00e1rbol, comprometiendo estados fenol\u00f3gicos claves.<\/p>\n\n\n\n

Como la prevenci\u00f3n es la \u00fanica arma de control efectiva descubierta a la fecha, Laboratorios Diagnofruit Ltda. con el apoyo de la Fundaci\u00f3n para la Innovaci\u00f3n Agraria (FIA) y un grupo de asociados y asesores especialistas desarrollaron protocolos de detecci\u00f3n basados en la realidad de las poblaciones locales de virus, estableciendo adem\u00e1s sistemas de muestreos m\u00e1s simples que facilitan los sistemas de monitoreos que se deben establecer para el control temprano de estos pat\u00f3genos.<\/p>\n\n\n\n

The gender Prunus <\/em>compromete al menos unas 250 especies originadas en Asia central. Un entretenido art\u00edculo describe c\u00f3mo cientos de a\u00f1os de intercambio comercial a trav\u00e9s de la Ruta de la Seda<\/a>, y junto a la domesticaci\u00f3n y mejoramiento, ha permitido tener hoy en d\u00eda las especies que consumimos de esta familia, como nectarines, duraznos, damascos, ciruelas y nuestras conocidas e importantes cerezas.En virtud de la importancia dentro del comercio de frutas y la dieta mundial, los virus y viroides que afectan a Prunus<\/em> revisten tambi\u00e9n suma importancia, ya que generan p\u00e9rdidas productivas y\/o deterioro en la calidad de las frutas (fig. 1). A pesar de lo mencionado, aun la descripci\u00f3n de estos pat\u00f3genos es limitada en Prunus<\/em>, se reduce solo algunas especies (Tabla 1) y las herramientas moleculares, son bienvenidas para la caracterizaci\u00f3n y el buen diagn\u00f3stico de estos pat\u00f3genos.<\/p>\n\n\n\n

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Figura 1. Frutos de cerezos con deformaciones atribuibles a virus, la muestra fue positiva a ACLSV, PNRSV y CVA.<\/em><\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

Como se muestra en la Tabla 1, si bien PNRSV y PDV podr\u00edan transmitirse por polen, lo que implica que el control del contagio es casi nulo, en otros pocos casos hay vectores (insectos, ara\u00f1itas y nem\u00e1todos) involucrados en la dispersi\u00f3n, lo cierto es que todos los virus y viroides de Prunus son f\u00e1cilmente transmitidos en la injertaci\u00f3n u otras t\u00e9cnicas de propagaci\u00f3n vegetativa.  <\/p>\n\n\n\n

Considerando todo lo anterior el control de enfermedades virales en frutales de carozo se basa esencialmente en medidas profil\u00e1cticas, uso de cuarentenas ara material sospechoso, desarrollo de certificaci\u00f3n de material vegetal, erradicaci\u00f3n de plantas positivas, control de vectores y la eliminaci\u00f3n de virus mediante termoterapia y cultivos in-vitro para generaci\u00f3n de plantas sanas. <\/p>\n\n\n\n

Por otro lado, y para complicar a\u00fan m\u00e1s el manejo, existe la conocida variabilidad gen\u00e9tica de los virus. Ya aprendimos con SARS-CoV-2 (COVID-19) y su amplia gama de variantes gen\u00e9ticas: Alfa, Beta, Gamma, Delta y \u00d3micron, que aparec\u00edan y nos preocupaban cada semana en medio de la pandemia.<\/p>\n\n\n\n

En el caso de los fitovirus el caso no es muy distinto. Estos pat\u00f3genos tienen una alta capacidad de mutar y persistir con a\u00fan mayor virulencia, lo que tambi\u00e9n impacta en su diagn\u00f3stico, como luego explicaremos.<\/p>\n\n\n\n

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Tabla 1.  Principales virus   y viroides que afectan especies cultivadas de Prunus adaptado de <\/em>Rubio et al. (2017<\/em><\/a>).<\/em><\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

A la luz de todos los conocimientos generados a nivel mundial, varias dudas estaban presentes sobre los virus en Chile; prevalencia, variantes gen\u00e9ticas, detecci\u00f3n confiable, se contaban como los aspectos m\u00e1s relevantes a resolver, a la hora, por ejemplo, de enfrentar restricciones paraarancelarias extremas (como la mencionada vigilancia China sobre las cerezas) y establecer una industria sostenible.<\/p>\n\n\n\n

Con estas dudas, el equipo de Diagnofruit <\/strong>se volc\u00f3 a la tarea de encontrar partners para resolverlas y con el apoyo de FIA, asociados de la academia como UDLA<\/strong> y directamente de la industria como PRIZE S.A.,<\/strong> FRUSAN S.A.,<\/strong> Exportadora Rancagua S.A.<\/strong>,MACE S.A<\/strong>., y Frutas de Chile <\/strong>(Comit\u00e9 de Cerezas de Chile-ASOEX) se logr\u00f3 llevar a cabo el proyecto: \u201cDesarrollo de qPCR M\u00faltiplex e Innovador Sistema de Toma de Muestras para Detecci\u00f3n Eficiente y de Bajo Costo de Virus en Prunus\u201d que por estos d\u00edas est\u00e1 en etapa de finalizaci\u00f3n.<\/strong><\/p>\n\n\n\n

La primera parte del proyecto nos permiti\u00f3 trabajar con tecnolog\u00eda de punta y realizar un catastro de los virus presentes en Chile en Prunus a trav\u00e9s de RNA-seq, lo que concluy\u00f3 con secuencias completas de m\u00e1s de 10 pat\u00f3genos virales, permitiendo conocer adem\u00e1s variantes descritas y locales (Fig.2), conocimiento clave para entender la din\u00e1mica de las poblaciones virales a nivel local, ya que m\u00ednimos cambios pueden generar grandes efectos a nivel epidemiol\u00f3gico, virulencia, etc.<\/p>\n\n\n\n

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Figura 2. Dendrograma de afiliaci\u00f3n gen\u00e9tica Cherry virus A construido con genomas completos de 22 cepas locales del virus a partir de an\u00e1lisis RNA-seq de plantas sintom\u00e1ticas de diversas especies de Prunus. En c\u00edrculos rojos clusters de variantes conocidas y en verde clusters de posibles variantes locales.<\/em><\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

Dicha informaci\u00f3n de base permiti\u00f3 dise\u00f1ar protocolos de qPCR adaptados para las poblaciones de virus presentes en Chile, asegurando un diagn\u00f3stico confiable.<\/p>\n\n\n\n

De forma muy simple, considerando varias cepas de un mismo virus, buscamos sectores espec\u00edficos en el genoma que nos permitieron desarrollar partidores para qPCR capaces de detectar todas las variantes del virus blanco, sin confundirse con otros virus ni tampoco con el material gen\u00e9tico propio del vegetal (situaci\u00f3n que podr\u00eda ocurrir en protocolos de PCR de tiempo final). <\/p>\n\n\n\n

Al mismo tiempo, sab\u00edamos que uno de los problemas de realizar estos an\u00e1lisis es el costo individual por virus, por lo que nosotros agrupamos la detecci\u00f3n. En otras palabras, en un mismo tubo de reacci\u00f3n se pueden detectar hasta 3 virus de forma simult\u00e1nea, lo que se logr\u00f3 a trav\u00e9s del uso de diferentes sondas, disminuyendo los costos en virtud de menor uso de mano de obra y reactivos, abarcando muchos m\u00e1s virus por el mismo precio o menor, en comparaci\u00f3n a an\u00e1lisis convencionales inmunol\u00f3gicos (ELISA) o de PCR de punto final, que adem\u00e1s son menos sensibles.<\/p>\n\n\n\n

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Figura 3. Detalle de toma de muestras con tarjetas FTA. <\/em><\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

Otro aspecto que el proyecto quiso abordar fue simplificar la toma de muestras, para esto se probaron tarjetas FTA (Fig. 3) que permiten realizar muestreos en campo sin enviar material vegetal al laboratorio, evitando grandes vol\u00famenes de muestras, espacio de trabajo y eventuales p\u00e9rdidas de sensibilidad de la t\u00e9cnica debido a sometimiento a estr\u00e9s de las muestras vegetales y disminuci\u00f3n de los virus por este efecto y generaci\u00f3n de falsos negativos.<\/p>\n\n\n\n

El proyecto tuvo car\u00e1cter de BIEN P\u00daBLICO<\/strong>, por lo que la informaci\u00f3n y, por supuesto los protocolos, est\u00e1n completamente disponibles para la industria nacional en distintas plataformas<\/strong>. <\/p>\n\n\n\n

Como primer objetivo, el proyecto ten\u00eda la tarea de generar un completo manual de laboratorio (Fig. 4) que contiene los protocolos para las qPCR-multiplex y las indicaciones para el muestreo con tarjetas y obtenci\u00f3n de material gen\u00e9tico desde las mismas. Este manual, fue revisado por los principales laboratorios de diagn\u00f3stico del pa\u00eds, lo que fue realmente muy constructivo ya que en cierta forma el contenido fue validado por pares (Fig. 5).<\/p>\n\n\n\n

Para descargar este manual puedes hacer <\/strong>click aqu\u00ed<\/strong><\/a>.<\/strong><\/p>\n\n\n\n

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Figura 4. Portada Manual: PROTOCOLOS DE IMPLEMENTACI\u00d3N DE TOMA DE MUESTRAS EN CAMPO Y AN\u00c1LISIS DE qPCR EN LABORATORIO PARA LA DETECCI\u00d3N EFICIENTE DE VIRUS EN PRUNUS.<\/em><\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n
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Figura 5. Fotos de presentaci\u00f3n de manual realizado el 5 de junio de 2025 en instalaciones de Copefrut S.A. En la diapositiva en primer plano se destacan las empresas externas y profesionales que participaron en la revisi\u00f3n del contenido del manual. Nuestros agradecimientos a: Natalia Camus y Patricia Ugalde de Lagric, Dra. M\u00f3nica Madariaga de INIA, Dra. Luc\u00eda Rivera de NemaChile, M\u00f3nica Santalices de AySLab, Gabriela Medina de Vitalab, Patricio Gonz\u00e1lez de C. Abud. & C\u00eda., Camila Gamboa de Laboratorio de Fitovirolog\u00eda de UChile y Dra. Claudia Carreras de DuocUC.<\/em><\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

Adem\u00e1s, como tareas secundarias de extensi\u00f3n se realizaron diversas actividades, charlas informativas de avances y una final (Figs. 5), que fue llevada a cabo en junio con la presencia del Dr. Vicente Pall\u00e1s, autoridad mundial en fitovirus, en especial de Prunus<\/em>. <\/p>\n\n\n\n

Esta presentaci\u00f3n se realiz\u00f3 en las instalaciones de Copefrut S.A., en Curic\u00f3, con gran \u00e9xito de concurrencia y participaci\u00f3n (Fig. 6) con jefes t\u00e9cnicos de exportadoras, viveristas, asesores y productores. <\/p>\n\n\n\n

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Figura 6. Asistentes al seminario de cierre del proyecto, Auditorio Jos\u00e9 Soler Mallafr\u00e9, Copefrut S.A. En la foto detalle, de izquierda a derecha: Dr. Alan Zamorano, Dra. Cecilia Ramos, Dr. Nicolas P\u00e9rez (FIA- Ejecutivo del proyecto) y H\u00e9ctor Garc\u00eda.<\/em><\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

Tambi\u00e9n fueron realizadas capacitaciones a personal de laboratorios externos en instalaciones de UDLA (Fig. 7) e in-situ<\/em>, considerando adem\u00e1s una sesi\u00f3n final exclusiva para el Servicio Agr\u00edcola y Ganadero (SAG) con el prop\u00f3sito de dar a conocer los protocolos para que el futuro sean probados por el organismo estatal.<\/p>\n\n\n\n

Creemos que el estudio de poblaciones virales, el desarrollo de protocolos y un manual para la detecci\u00f3n de virus en Prunus<\/em> es el piso para el establecimiento de una industria de frutos de carozo sostenible, ahora esperamos que los laboratorios puedan habilitar la metodolog\u00eda y los productores, viveristas y exportadores env\u00eden muestras a an\u00e1lisis con el prop\u00f3sito no s\u00f3lo de conocer el estatus de plantaciones en producci\u00f3n, sino que lo m\u00e1s importante: diagnosticar nuevas plantaciones, recordando que el principal manejo de control es la prevenci\u00f3n y partir con plantas sanas un nuevo proyecto<\/strong> es, sin duda, la base de una producci\u00f3n de calidad y de largo plazo.<\/p>\n\n\n\n

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Figura 7. Actividades de capacitaci\u00f3n para laboratorios externos realizadas en instalaciones de UDLA- Laboratorio de investigaci\u00f3n, Campus Providencia<\/em>.<\/figcaption><\/figure>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Por H\u00e9ctor Garc\u00eda O., Co-Fundador y Gerente Gral. de Laboratorios Diagnofruit Ltda.; Dr. Miguel L\u00f3pez J., Gerente T\u00e9cnico Laboratorios Diagnofruit Ltda.; Dra. Cecilia Ramos B., Acad\u00e9mica UDLA; y Dr. Alan Zamorano C., Profesor Asociado Universidad de Chile.<\/p>","protected":false},"author":273,"featured_media":44645,"comment_status":"closed","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"inline_featured_image":false,"footnotes":""},"categories":[3428,436],"tags":[125,292,2791,2907],"category_proveedor":[],"pais":[],"class_list":["post-47095","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-articulo-tecnico","category-columnista","tag-cerezos","tag-prunus-necrotic-ringspot-virus","tag-carozos","tag-hector-garcia-3"],"acf":[],"yoast_head":"\nDetecci\u00f3n temprana de virus en cerezos y otros carozos: Uno de los pilares para una producci\u00f3n sostenible - Smartcherry<\/title>\n<meta name=\"description\" content=\"Hace unos a\u00f1os, China, el principal comprador de cerezas chilenas, comenz\u00f3 un protocolo de vigilancia sobre uno de los 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